---

Course Modules

| Assalamu'alaikum wr wb. Selamat datang kembali di Dunia Mikroorganisme Sudahkah Anda mengambil matakuliah Mikrobiologi (Pengantar/Umum) Saya ucapkan selamat kepada Anda jika telah menempuh matakuliah Mikrobiologi (Pengantar/Umum). Fisologi Mikrobia adalah jendela berikutnya bagi Anda setelah belajar matakuliah Mikrobiologi (Pengantar/Umum). Dapatkah Anda bercerita secara singkat mengenai Gambar 1 Masihkah Anda ingat termasuk mikroba jenis apakah ia Bagaimana cara hidup dan cara memperoleh sumber nutrisinya untuk lebih jelasnya perhatikan video pendek mengenai Mikroba pada usus manusia. -Pada matakuliah ini Capaian pembelajaran lulusan yang diharapkan yakni mahasiswa mampu memahami proses-proses nutrisi, respirasi, fermentasi, pertumbuhan, metabolisme sekunder, serta iritabilitas mikroba. -Terdapat sejumlah topik yang akan Anda pelajari yakni; Mikroorganisme sebagai sel Klasifikasi organisme hidup Kimia sel (yang meliputi atom, molekul, monomer dan polimer) Nutrisi, metabolism, dan biosintesis Enzim dan bioteknologi, makromolekul dan genetika molekuler Genetika mikroba Manipulasi dan rekayasa genetika Kontrol pertumbuhan Bioteknologi mikroba Mikrobiologi kedokteran Archaebacteria -Perkuliahan akan dilakukan dalam peer teaching group oleh beberapa Dosen Dr. Sumardi M.Si. Dra. Christina Nugroho Ekowati, M.Si. Achmad Arifiyanto M.Si. - Strategi Perkuliahan Kuliah diberikan kepada mahasiswa S1 yang mengambil mata kuliah ini sebagai keahlian khusus bidang Mikrobiologi. Perkuliahan dilakukan sebanyak 14 kali pertemuan kuliah tatap muka dan 12 kali praktikum. Metode perkuliahan adalah kombinasi antara ceramah, diskusi, dan latihan. Sedangkan praktikum dilaksanakan dengan metode tutorial dan latihan. Mahasiswa wajib mengikuti perkuliahan minimal 80 persen, dan praktikum 80 persen. Mahasiswa pengulang diwajibkan mengikuti keseluruhan kegiatan kuliah dan praktikum selama satu semester. - Tugas Tugas diberikan pada saat kuliah dan wajib dikerjakan oleh mahasiswa, dan hasilnya dikumpulkan sesuai dengan waktu yang telah ditetapkan. - Kriteria Penilaian Untuk menentukan nilai akhir digunakan perhitungan pembobotan sebagai berikut: UTS..................................................30% UAS..................................................30% Tugas .................................................5% Praktikum..........................................30% Kehadiran .........................................5% Nilaiakhir (0-100) Huruf mutu (hm ) Angka mutu (a m ) Status penilaian Nilai 76 A 4 Lulus 71 nilai < 76 B 3,5 Lulus 66 nilai < 71 B 3 Lulus 61 nilai < 66 C 2,5 Lulus 56 nilai < 61 C 2 Lulus 50 nilai < 56 D 1 Lulus * Nilai <50 E 0 Tidaklulus dengan kata lain mudah bukan untuk memperoleh kelulusan dan nilai tidak perlu memperoleh 100 (sempurna), cukup 80 saja sudah A ;-) - Tata tertib Hadir paling lambat 15 menit. Mahasiswa TIDAK DIPERKENANKAN masuk kelas setelah 15 menit kuliah dimulai. Berpenampilan dan berbusana sopan serta rapi dengan menggunakan kemeja berkera atau Polo Shirt untuk kaos Alas kaki bersepatu (tidak diinjak bagian belakangnya) tidak menggunakan sandal atau sejenisnya Tidak ada ujian dan penugasan susulan atau perbaikan

---

Course Modules

Achmad Arifiyanto S.Si., M.Si. achmad.arifiyanto@fmipa.unila.ac.id Data pribadi Tempat & Tanggal Lahir : Sidoarjo, 30 Nopember 1990 Agama : Islam Jenis Kelamin : Laki-laki Pendidikan SMAN 3 Sidoarjo Dep. Biologi Fakultas Sains, Institut Teknologi Sepuluh Nopember Surabaya Dep. Biologi Fakultas Sains dan Teknologi Universitas Airlangga Artikel Ilmiah ( click ) Scopus Author ID: 57194835048

---

Course Modules

Selamat datang di Pertemuan topik pertama dari materi kita. Sebelum kita mulai sesi kita mari kita awali dengan, | Semoga kita memperoleh Rahmat dan IlmuNya dalam belajar :-) Sesi kali ini kita akan mengupas tentang " Mikroorganisme sebagai Sel". Mari kita kenali secara terminologi ;-). Saya tidak meragukan pengetahuan anda apa itu mikroorganisme karena Anda telah lulus matakuliah mikrobiologi. Coba kita ingat kembali apa itu sel apakah semua sel itu identik dengan mikroorganisme apakah semua sel berukuran mikron Apa pendapat Anda tentang telur ayam di bawah ini Jika subunit terkecil Fisika-Kimia ialah atom, maka Sel adalah unit struktural dan fungsional terkecil dari makhluk hidup. Mikroorganisme merupakan organisme kosmopolit yang dapat kita jumpai dalam ukuran mikron di pelbagai lingkungan habitat dengan perannya dalam biosfer kita. Banyak mikroba dikelompokkan ke dalam organisme bersel tunggal (Siapa sajakah mikroorganisme bersel tunggal ), akan tetapi adapula yang memiliki struktur kompleks bahkan sebagian di antaranya multiseluler (Dapatkah anda memberikan contoh mikroba kelompok multiseluler ).

---

Course Modules

Berjumpa kembali masih di kuliah Fisiologi Mikrobia Mari kita awali perkuliahan kita dengan ucapan | Semoga kita memperoleh berkah untuk niat belajar kita hari ini. Pada topik ini kita kan membahas mengenai Klsifikasi organisme hidup, mengapa perhatikan Gambar di bawah ini, Berdasarkan apakah Pohon filogeni pada gambar di atas dibuat Kesamaan morfologi tidak dapat membantu untuk menyusun pohon filogeni di atas. Pendekatan molekuler dengan membandingkan Sequences RNA diperoleh 3 kelompok besar domain. Bagaimana kedudukan domain dalam level taxa Anggota domain Bacteria dan Archaea mempunyai kesamaan dalam hal ketiadaan membran inti dan karakter fisiologis sehingga digolongkan sebagai kelompok Prokaryotic. Sedangkan anggota Fila dari Domain Bakteria berkmbang menjadi lbih banyak Dari gambaran perkembangan taxa di atas dapat kita ketahui pengaruh penggunan materi genetik, khususnya RNA. Mengapa RNA yang digunakan sebagai materi genetik pembanding mengapa bukan DNA apa perbedaan RNA dan DNA Penambahan anggota Fila dari Domain bakteri selain menggunakan data pembanding RNA juga menggunakan data fisiologis. Dan pada topik selanjutnya kita akan semakin memahami kekayaan mekanisme fisiologis mikroorganisme dalam menyikapi perubahan lingkungan dan keebutuhan hidupnya untuk mengetahui lebih detail silahkan buka ppt dan video di bawah ini Youtube

---

Course Modules

Selamat datang kembali pada pertemuan ke 3 Mari kita awali perkuliahan kita dengan ucapan | Semoga kita memperoleh berkah untuk niat belajar kita hari ini. Pada topik ini kita kan membahas mengenai Kimia Sel Pada pertemuan sebelumnya telah saya singgung bahwa materi terkecil dari sebuah unit kajian Biologi ialah sel, sedangkan sub unit terkecil dari materi Fisika dan Kimia ialah atom Apakah atom itu sendiri menurut Anda Semua masalah apakah udara, batu, atau organisme hidup dibuat unit kecil yang disebut atom. Atom adalah komponen terkecil suatu zat, dan itu tidak dapat dibagi lagi menjadizat lebih keciltanpa kehilangan sifatnya. Atom bergabung membentuk molekul. Sel-sel hidup terdiri dari molekul, sebagian yang sangat kompleks. Ilmu interaksi antara atom dan molekul disebut kimia. Atom adalah unit terkecil dari materi yang masuk ke dalamnya reaksi kimia. Setiap atom memiliki lokasi inti terpusat dan 1-2 partikel bermuatan negatif yang disebut elektron yang bergerak di sekitar nukleus di daerah yang disebut kulit elektron (Gambar 3.1). Inti terdiri dari muatan positif 1 2 partikel yang disebut proton dan partikel yang tidak bermuatan (netral) disebut neutron. Karena itu, nukleus menghasilkan muatan totalpositif. Semua atom mengandung jumlah elektron dan proton yang sama. Karena muatan positif total inti sama dengan muatan negatif total elektron, masing-masing atom netral secara listrik. Unsur atau Elemen Semua atom dengan jumlah proton dan sifat yang sama secara kimiawi diklasifikasikan sebagai unsur bahan kimia yang sama. Setiap elemen atau unsur memiliki satu atau dua huruf simbol sendiri, biasanya berasal dari bahasa Inggris atau nama Latin. Misalnya, simbol untuk elemen hidrogen adalah H, dan simbol untuk karbon adalah C. Simbol untuk natrium adalah Na dua huruf pertama dari nama Latinnya, natrium membedakan dari nitrogen, N, dan dari sulfur, S. Ada 92 elemen yang terjadi secara alami. Namun, hanya sekitar 26 elemen umumnya ditemukan pada makhluk hidup. Sebagian besar unsur memiliki beberapa isotop atom dengan jumlah neutron yang berbeda dalam nukleus mereka. Semua isotop suatu unsur memiliki jumlah proton yang sama dalam nukleusnya, tetapi memiliki proton massa atom berbeda karena perbedaan jumlahnya dari neutron. Misalnya, dalam sampel oksigen alami, semua atom mengandung delapan proton. Namun, 99,76% dari total atom memiliki delapan neutron, 0,04% mengandung sembilan neutron, dan 0,2% sisanya mengandung sepuluh neutron. Karena itu ketiga isotop yang menyusun sampel oksigen alami memiliki atom massa 16, 17, dan 18, meskipun semua akan memiliki nomor atom 8. Nomor atom ditulis sebagai subskrip ke sebelah kiri simbol kimia elemen. Massa atom ditulis sebagai superskrip di atas nomor atom. Jadi isotop alami oksigen direpresentasikan sebagai 16O8, 17O8, 18O8. Isotop unsur-unsur tertentu sangat berguna (lhat tabel di bawah ini) dalam penelitian biologi, diagnosis medis, pengobatan beberapa gangguan, dan beberapa bentuk sterilisasi Lainnya. Konfigurasi elektron Dalam sebuah atom, elektron disusun dalam kulit elektron, yaitu daerah yang sesuai dengan tingkat energi yang berbeda. Pengaturan tsb disebut konfigurasi elektron. Susunan kulit berlapis keluar dari inti, dan masing-masing cangkang dapat memiliki karakteristik jumlah maksimum elektron dua elektron dalam kulit terdalam (tingkat energi terendah), delapan elektron di kulit kedua, dan delapan elektron di kulit ketiga, jika itu adalah kulit terluar atom (valensi). Yang keempat, kelima, dan keenam kulit elektron masing-masing dapat menampung 18 elektron, meskipun ada beberapa pengecualian untuk generalisasi ini (perhatikan tabel di bawah ini). Bagaimana atom membentuk ikatan kimia (Perhatikan lebih lanjut dalam video di bawah ini) Youtube Ketika tingkat energi terluar atom tidak sepenuhnya diisi oleh elektron, Anda dapat menganggapnya sebagai salah satu ruang yang tidak terisi atau elektron ekstra di tingkat energi itu, tergantung pada apakah lebih mudah bagi atom untuk mendapatkan atau kehilangan elektron. Contoh atom oksigen, dengan dua elektron di tingkat energi yang pertama dan enam di kulit kedua, memiliki dua ruang kosong di kulit elektron kedua; sebuah atom magnesium memiliki dua tambahanelektron dalam kulit terluarnya. Secara kimiawi konfigurasi paling stabil untuk setiap atom adalah setiap kulit terluarnya terisi. Karena itu, agar kedua atom ini mencapai keadaan itu, oksigen harus mendapatkan dua elektron, dan magnesium harus kehilangan dua elektron. Karena semua atom cenderung bergabung sehingga elektron ekstra di kulit terluar dari satu atom mengisi ruang-ruang terluar kulit atom, oksigen dan magnesium lainnya bergabung sehingga kulit terluar dari setiap atom memiliki pelengkap lengkap dari delapan elektron. Valensi , atau kapasitas gabungan, dari atom adalah bilangan elektron ekstra atau yang hilang di kulit elektron terluarnya. Sebagai contoh, hidrogen memiliki valensi 1 (satu ruang yang tidak terisi, atau satu elektron ekstra), oksigen memiliki valensi 2 (dua ruang tidak terisi), karbon memiliki valensi 4 (empat ruang tidak terisi, atau empat elektron ekstra), dan magnesium memiliki valensi 2 (dua ekstra elektron). Pada dasarnya, atom mencapai pelengkap elektron yang lengkap dalam kulit energi terluar mereka dengan bergabung membentuk molekul , yang terdiri dari atom-atom satu elemen atau lebih. Molekul yang mengandung setidaknya dua jenis atom, seperti H2O (molekul air), disebut senyawa . Di H2O, subskrip 2 menunjukkan bahwa ada dua atom hidrogen; tidak adanya subskrip menunjukkan bahwa ada hanya satu atom oksigen. Molekul menjadi satu karena elektron valensi dari atom-atom yang bergabung membentuk kekuatan atraktif, yang disebut ikatan kimia , antara inti atom. Oleh karena itu, valensi juga dapat dilihat sebagai kapasitas ikatan dari suatu elemen . Secara umum, atom membentuk ikatan dalam salah satu dari dua cara: dengan salah satunya mendapatkan atau kehilangan elektron dari kulit elektron terluarnya, atau dengan berbagi elektron luar . Ketika atom dapat dapat bertindak untuk menerima atau kehilangan elektron terluar, ikatan kimia disebut ikatan ionik . Ketika elektron terluar dibagi (dipakai bersama (h):-D), disebut ikatan kovalen . Meskipun kita akan membahas ikatan ionik dan kovalen secara terpisah. Akan muncul di benak kita, lantas bagaimana ikatan yang terjadi pada molekul biologis Perhatikan video di bawah ini Youtube

---

Course Modules

Selamat datang kembali pada pertemuan ke 4 Mari kita awali perkuliahan kita dengan ucapan | Semoga kita memperoleh berkah untuk niat belajar kita hari ini. Pada topik ini kita kan membahas mengenai Nutrisi, Metabolisme dan Biosintesis. Karena topik pembahasan ini merupakan salah satu esensi dari Capaian Pembelajaran Matakuliah ini maka topik untuk sesi ini akan diperdalam sebanyak 3 sesi pertemuan Metabolisme adalah serangkaian reaksi biokimiawi sel memecah atau biosintesis berbagai metabolit. Untuk tumbuh, sel harus memasukkan nutrisi dari lingkungan mereka, mengubahnya menjadi molekul prekursor, dan kemudian digunakan mereka membangun sel baru. Dalam bab ini kita akan membahas beberapa proses-proses ini, dengan fokus pada tiga bidang: (1) mendefinisikan dasar nutrisi kehidupan, (2) menjelajahi jalur metabolisme utama dan pola metabolik alternatif, (3) serta Biosintesis makromolekul. Ahli biologi dan ahli kimia membagi senyawa menjadi dua pokok kelas: anorganik dan organik . Senyawa anorganik didefinisikan sebagai molekul, biasanya kecil dan sederhana secara struktural, yang biasanya tanpa karbon dan ikatan ionik memainkan peran penting. Senyawa organik selalu mengandung karbon dan hidrogen dan biasanya kompleks secara struktural. Karbon adalah elemen unik karena memiliki empat elektron di kulit terluarnya dan empat ruang kosong. Itu dapat bergabung dengan berbagai atom, termasuk atom karbon lainnya, untuk membentuk rantai lurus atau bercabang dan berdering. Rantai karbon membentuk dasar dari banyak senyawa organik dalam sel hidup, termasuk gula, asam amino, dan vitamin. Senyawa organik disatukan sebagian besar atau seluruhnya oleh ikatan kovalen. Beberapa molekul organik, seperti polisakarida, protein, dan asam nukleat, sangat besar dan biasanya mengandung ribuan atom. Molekul raksasa seperti itu disebut makromolekul. Pada bagian berikut ini kita akan membahas anorganik dan senyawa organik yang penting untuk sel. Karena kapasitas metabolisme mikroba berbeda, nutrisi mereka persyaratannya juga berbeda. Namun, semua mikroba memerlukan satu set nutrisi utama. Beberapa nutrisi, yang disebut macronutrients , diperlukan dalam jumlah besar, sementara yang lain, yang disebut micronutrients , diperlukan dalam jumlah kecil.Perhatikan tabel di bawah ini selanjutnya mari kita cermati video berikut ini Youtube

---

Course Modules

---

Course Modules

---

Course Modules

---

Course Modules

---

Course Modules

---

Course Modules

---

Course Modules

---

Course Modules

---

Course Modules

---

Course Modules

---

Course Modules

---

Course Modules

---

Course Modules